一.节约用水。每次只需半加仑的水(约为2升的水\此水可以是飞机上使用的蓝色消毒液)，地面上使用的普通马桶、节水马桶，每次需要1.6加仑(6升)的水，老式马桶则需要5加仑(19升)的水。
二.真空马桶的下水道管径可制作得更为细致。
三.这种马桶朝向任何方向都可将脏东西带走，不像普通马桶非得朝下方向。如此一来，管道便可任意地铺设。
四.因管道可以随意铺设，所以在安装新马桶时也不需要将地板敲开。
六.真空马桶可以安装在房间的任何地方。
七.真空马桶可将大小便分离，大便径直进入肥料厂制成有机肥料，而小便、洗澡水和洗菜水之类的，都可以流入家门口的“人工小湿地”，待液体中的氮磷等营养成分被植物吸收之后，就可以得到供于景观的二类水。
真空马桶系统带有真空泵，将系统整体制成真空状态，在通向每个马桶的道上都会有一道隔离阀将其与系统相隔。当冲马桶时，此道阀便会开启，这是依靠与大气压之间的压差，来清理马桶内的东西的。此套真空系统是依靠真空泵的自动运行来维持，较为复杂，尤其是马桶上的控制阀。